Южно-Казахстанский областной Центр по профилактике и борьбе со СПИД функционирует с 1989г. на основании приказа УЗ ЮКО за № 323-П от 18.07.1989г. ОЦ СПИД является государственным коммунальным казенным предприятием.
В структуре имеет следующие подразделения:
- Административный персонал
- Хозяйственный персонал
- Организационно-методический отдел
- Эпидемиологический отдел
- Отдел профилактических работ
- Отдел лечебно-профилактических работ и диспансеризации
- Диагностическая лаборатория
- Отдел информатики и компьютерного надзора за ВИЧ инфекцией