Оңтүстік Қазақстан облысы денсаулық сақтау басқармасының 1989 жылы 18 шілдедегі № 323 бұйрығы негізінде «Облыстық СПИД-тің алдын алу және онымен күресу орталығы» 1989 жылдан жұмыс істеуде. Облыстық СПИД орталығы Мемлекеттік Коммуналдық Қазыналық кәсіпорын болып табылады 2018 жылы бекітілген штаттық кестесі.
- Әкімшілік бөлімі;
- Шаруашылық бөлімі;
- Әдістемелік-ұйымдастыру бөлімі;
- Эпидемиологиялық бөлімі;
- Профилактикалық жұмыстар бөлімі;
- Емдеу алдын алу жұмыстары мен диспансерлеу бөлімі;
- Диагностикалық зертхана бөлімі;
- Ақпараттық және АИТВ-індетін компьютерлік бақылау бөлімі;